椎间孔镜是目前非常热门的一项脊柱微创技术，较之传统开放手术而言具有很多优势，但是任何一项手术都存在并发症的发生率。椎间孔镜的并发症主要有以下方面：
1、椎管内血肿形成：因为椎间孔镜较传统手术而言，其操作在椎管的自然腔隙内，如果有静脉丛出血，止血方式较开放手术会存在不足，有时椎间孔镜术后会有椎管内血肿形成，患者术后可能会有腰部胀痛甚至神经根性刺激症状，需要行磁共振检查以明确；
2、神经损伤：椎间孔镜与传统开放手术相同，主要目的是行椎间盘摘除和神经根的减压，在手术过程中，若出现神经根粘连或者神经根变异，则可能误伤神经。术后根据损伤程度的不同，可以采取保守治疗方法或者在镜下做二次减压、开放手术；
3、其它情况：与传统的开放手术类似，可能会出现心脑血管意外、伤口感染等意外情况。