对于妇科疾病，支原体治疗一般是2周，不超过14天即可。支原体在身体里广泛存在，比如它又可以产生支原体性肺炎，在妇科可以产生支原体性阴道炎、盆腔炎等。
支原体是一个自限性的微生物，一般在身体免疫力特别强的情况下不致病，这时如果查出支原体阳性可以不治疗。但是当免疫力差时，支原体就会产生炎症的作用。比如解脲支原体在免疫力差时，男性会产生泌尿系的感染，有尿痛、尿频、尿不尽的感觉。
女性也会产生泌尿系的感染，比如尿急、尿频、尿痛，同时还可以产生阴道感染，比如阴道分泌物增多、阴道肿痛、阴道分泌物、刺痛等，这时可以治疗。一般治疗支原体的药物都要做敏感试验，通过支原体的敏感试验找出最敏感的抗生素进行治疗，效果最好。
一般是大环内酯类的抗生素，比如红霉素、阿奇霉素，也可以用左氧氟沙星、拜复乐即莫西沙星，都可以进行治疗。
