喝水呛了一直咳，要根据其具体原因决定治疗办法。如果呛咳是因为不良的习惯引起，比如躺在床上饮水或喝水速度非常快或喝水的同时笑、说话，都容易引起呛咳，需要纠正此类不良习惯。除不良习惯之外，还病理学原因，如咽喉部本身有疾病，比如咽喉部有病毒性炎症，引起肌肉吞咽功能有障碍引起饮水呛咳，需要进行抗炎治疗同时观察肌肉功能。

还有就是中枢问题，如脑缺血、脑梗塞、脑出血均会引起吞咽肌肉失去灵活性，导致在饮水时出现呛咳。需要进行康复训练，用冷、热刺激性东西，刺激咽喉部，训练吞咽的肌肉，或在没喝水、没有吃饭时做吞咽动作，锻炼吞咽肌，使吞咽功能得到恢复。