乳腺癌靶向治疗主要针对HER-2阳性患者。靶向药物相对于化疗，副作用较小，痛苦较小。但毕竟为药物，因此会存在副作用。如曲妥珠单抗、帕妥珠单抗、TDM-1、口服马来酸吡咯替尼、拉帕替尼等药物，不同药物存在不同副反应。

曲妥珠单抗、帕妥珠单抗对心脏具有毒性；吡咯替尼、拉帕替尼对血象、肝肾功能存在影响。不同药物在不同患者身上，反应不完全相同。化疗后出现恶心、呕吐、腹泻等症状者较少，小部分患者可出现皮疹。