新生儿耳畸形由多因素造成，目前难以判断究竟为何种因素直接导致畸形状况的出现，通常考虑与以下因素有关：

1、遗传因素：如父母或亲属中存在同样的耳廓畸形情况，则新生儿耳畸形可能由遗传因素造成；

2、感染因素：胎儿在母体内时，如母亲感染某些致病病毒，从而造成胚胎发育异常，同样可造成新生儿耳廓发育异常；

3、基因突变：目前发现一些可造成耳廓畸形出现的基因，以及伴随耳廓畸形的综合征的基因。