骨组织引导再生术的适应症包括牙槽骨宽度不足、牙槽骨外形不良、骨开窗或者骨开裂等，还有在正畸过程中做PAOO的手术时，用于增厚前牙唇侧骨板，以保护牙齿，避免在移动过程中出现松动、牙龈退缩。总的来讲，只要发生牙槽骨外形不良或者骨缺损，都可以考虑使用骨组织引导再生术恢复牙槽骨理想的外形和生理功能。
骨组织引导再生术禁忌症同牙周组织引导再生术的禁忌症相类似。首先牙周炎一定要控制，因为牙周炎患者牙槽骨上会有细菌的破坏及毒素堆积，而如果牙槽骨上有过多细菌或者毒素，可能使骨组织引导再生术失败。所以进行骨组织引导再生术前，必须先控制牙周炎症。其次，如果长期服用骨质疏松药物者，如双膦酸盐，也不适宜进行骨组织引导再生术。一般在停药后半年，甚至一年以后，进行手术会比较安全。因为服用此类药物的患者骨组织代谢会受抑制，植骨以后，骨粉不能够成骨，甚至有可能出现死骨，所以不适宜做骨组织引导再生术。此外，短期内接受过放化疗或者相应基础疾病治疗的患者，比如心绞痛、心肌梗死、脑梗或者有植入物的患者，一般建议观察半年以后，待生命体征或者其它疾病稳定后，进行骨组织引导再生术。
