过氧化物酶是甲状腺合成甲状腺激素必需的酶，平常包在甲状腺细胞里，是不会暴露于甲状腺细胞以外的，所以正常人体是没有抗过氧化物酶抗体的。白细胞会产生抗体，白细胞像人体卫兵一样或警卫一样，不应该攻击人体的组织，抗过氧化物酶抗体，就是人体白细胞对甲状腺非常重要的酶发起了攻击，产生的抗体。

抗过氧化物酶抗体升高是异常的病态过程，严重慢性抗过氧化物酶抗体升高就会导致甲状腺发生桥本甲状腺炎，严重的话会发生甲状腺功能减退。正常人体是没有抗甲状腺过氧化物酶抗体的，一旦发生甲状腺过氧化物酶抗体阳性，甲状腺组织就会受到攻击，就可能会出现甲状腺功能减退的问题。