儿童可以服用甲硝唑，甲硝唑属于抗菌素，但抗菌范围较为特殊，针对厌氧菌感染以及原虫感染，如阿米巴原虫感染，具有较好抗感染作用。6个月以上儿童如果出现厌氧菌感染或原虫感染时，可服用甲消唑进行治疗。此外，甲消唑有时可用于口腔感染，因口腔属于厌氧环境容易滋生厌氧菌。

此外，儿童常见普通为需氧菌感染，若为需氧菌感染则无需使用甲硝唑，使用甲硝唑后效果并不理想。另外，在给儿童使用甲硝唑时，需在医生指导下，按照标准剂量服用，部分儿童服用后可能出现胃肠道反应，如恶心、呕吐等。