畸胎瘤大部分无特异性临床症状，多数患者是在B超检查中才偶然发现。良性畸胎瘤里含有很多种成分，包括皮肤、毛发、牙齿、骨骼、油脂、神经组织等。恶性畸胎瘤分化欠佳，没有或少有成形的组织，结构不清。

此外，畸胎瘤会造成卵巢重心发生偏移，部分患者会由于剧烈活动或者体位的改变，造成肿瘤破裂、扭转，患者就会出现严重的急腹痛。也有部分畸胎瘤会影响人体激素的分泌，导致患者月经紊乱。