肾穿刺在泌尿外科和肾内科都有不同的指征，所以进行肾穿刺的原因也不同，具体如下：
一、肾内科：
1、了解肾衰的原因：对于不明原因的肾脏功能衰竭，排除了肾外性的因素，做肾穿刺可以尽快了解肾衰的原因，给予针对性治疗；
2、明确肾炎的亚型：建议做肾穿刺的原因是怀疑可能是某种类型的肾炎或者肾病综合征，只有在穿刺明确肾炎的亚型后，才能够根据病理，采用精准的治疗手段、治疗方案，如果不能够明确肾炎的分型，治疗效果会大打折扣，而且现在的肾穿刺可以使用微小的针刺进行，所以并发症发生的概率也会大大降低。
二、泌尿外科：
在肾脏的肿瘤无法通过常规的CT或核磁得到明确诊断，当诊断有疑问时，建议患者进行肾脏穿刺。
既往还有顾虑，认为肾脏穿刺可能会带来种植转移，事实上在临床上几乎没有见到，因肾肿瘤穿刺而造成沿针道的种植转移。所以，当临床上真的有疑问，需要改变或者根据肾穿刺的病理采用不同的治疗策略时，需要做穿刺就要做，才能够取得最好的临床治疗效果。
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