慢性粒细胞白血病的鉴别诊断如下：

1、类白血病反应：由于严重创伤、烧伤、中毒或急性溶血，引起粒细胞极度增生，检查可发现Ph染色体阴性，骨髓BCR-ABL融合基因阴性，碱性磷酸酶积分增高；

2、真性红细胞增多症：表现为红细胞、白细胞增多；

3、原发性血小板增多症：以血小板极度增生为主，可伴白细胞增多；

4、骨髓纤维化：表现为骨髓三系细胞增生。 

后三类疾病通常有特征性基因突变，如JAK2、MPL和CALR基因，但没有BCR-ABL融合基因，即Ph染色体，可与慢性粒细胞白血病相鉴别。