腹部MRI的适应证相对CT检查较少，针对肝脏、脾脏、胰腺、肾上腺、双肾等实质性器官，其呼吸运动度较小，可通过屏气达到器官静止不动的状态，检查效果较好。此外，针对子宫、卵巢、前列腺等盆腔部疾病，首选MRI检查，若存在病变，可通过检查明确诊断。例如育龄期妇女，经MRI可观察其卵巢状态，甚至卵泡亦可明确辨认。因此，若发生卵巢病变，如卵巢肿瘤时，经CT检查往往无法定性，可经MRI检查确诊。