在临床中，目前尚已明确与黄疸相关的基因多达160余种，要准确诊断母乳性黄疸，就必须先排除所有可能导致黄疸的病理性因素。通常医生会根据个人的临床经验，结合诊断性治疗得出结论。
在判断母乳性黄疸之前，首先要确定宝宝的基本状态，即是否为“五好”宝宝，即吃得好、睡得好、长得好、玩得好、拉得好，并且为纯母乳喂养。另外，通过临床常规检查后可排除常见疾病，比如感染、肝胆疾病、蚕豆病、溶血等因素，此时医生会高度怀疑是母乳性黄疸。首先会建议家长坚持1周以上的混合性喂养，即每天加1-2次牛奶，或者试着停止母乳3-5天，如果胆红素明显下降就可以考虑为母乳性黄疸。由于母乳是宝宝最好的食物来源，当胆红素下降到标准数值的一半以上后，建议家长恢复母乳喂养。
