霉菌性阴道炎即外阴阴道假丝酵母菌病，阴道炎不需要吃阿莫西林，也不建议吃。阿莫西林可以治疗其他细菌感染引起的炎症，包括呼吸道感染、泌尿道感染等。
而阴道炎指的是阴道局部发生炎症，如果是细菌性阴道病，可以使用甲硝唑或者克林霉素治疗。阴道局部菌群有相当一部分是厌氧菌，需要使用针对厌氧菌的抗生素，而阿莫西林针对是需氧菌。
如果是外阴阴道假丝酵母菌病，主要是菌群失调、白色念珠菌生长所致，需要使用抗真菌的药物。此时如果使用阿莫西林，会进一步破坏阴道局部菌群，加重外阴阴道假丝酵母菌病的症状。有些患者的外阴阴道假丝酵母菌病，就是在服用抗生素治疗其他疾病期间所发生。
如果发生真菌性阴道炎，抗生素包括阿莫西林尤其需要禁忌。对于其他阴道炎，如滴虫性阴道炎，需要特异性使用口服甲硝唑或外用甲硝唑，也不需要阿莫西林。
