功能性鼻窦内窥镜手术，不同于传统根治性鼻窦手术，它是通过内镜手术去除掉影响鼻腔、鼻窦引流的不可逆的病变，在改善鼻腔通气引流的同时，保留鼻腔的功能。而传统手术是破坏性的手术，去除病变后鼻腔功能不能完全保留。

功能性鼻内镜手术适合治疗慢性鼻窦炎、鼻息肉、鼻腔、鼻窦肿瘤等情况。青春发育期的青少年不适合做功能性鼻内手术，因为其骨的发育还未完全成熟，这种情况下不宜做鼻内镜手术。而在鼻腔内恶性肿瘤范围很大的情况下，通过鼻内镜鼻窦手术不能切除干净，需要做开放性手术才能解决问题。