腺肌症的治疗，要根据患者的年龄，还有生育要求，以及病情的严重程度治疗。对症状较轻，痛经较轻的患者，可以口服非甾体类的抗炎药，如布洛芬、双氯芬酸钠，以及口服中成药、避孕药治疗。
症状较重的有生育要求的女性，可以肌注GnRHa缓解症状，减轻痛经，同时也可以上曼月乐环缓解痛经。对于接近绝经期的女性，可以注射促肾上腺皮质激素释放激素的激动剂，促进尽早绝经，达到临床治愈的目的。对于症状较严重，年龄较大，应用药物治疗效果较差的子宫腺肌症患者，可以行子宫切除术，达到临床治愈的目的。
另外，对于有生育要求的女性，应该应用药物治疗，虽然停药后会复发，尽快地应用GnRHa治疗。停药以后恢复排卵，可以促进尽早怀孕，也可以辅助生殖技术助孕，达到完成生育的目的。
