肺孢子菌丝病，旧称肺孢子虫病，起初被归为原虫，自1988年后，发现它的临床症状及发病过程与真菌病类似，因此被重归为真菌病。肺孢子菌为条件致病菌，富有传染性，通过呼吸道传染。患者大多为免疫功能低下的人群，如进行过脏器移植的患者、长期使用糖皮质激素或免疫抑制剂、患有HIV、经过化疗等造成细胞免疫功能低下的人群。