多系统器官功能衰竭合并休克在临床中病情较为危急，应及时缓解病情，否则器官功能衰竭继续加重，严重者甚至引起死亡。首选应该进行抗休克治疗，若患者肺功能衰竭需呼吸机辅助呼吸，若患者肾功能衰竭需进行血液透析。然后进行器官功能保护，可采取药物治疗保护肝功能、心功能、肾功能等。若发生水电解质紊乱、浮肿、血压降低等症状，可进行对症治疗。此外，还需寻找引起器官功能衰竭的病因，针对病因进行治疗，为治疗的关键。