脑积水分流的治疗费用取决于治疗周期。目前，分流手术有两种方式，一种是单次分流，另一种则是分期手术。单次分流手术费用通常在5-6万元，患者住院时间短，适用于自发性脑积水和经脑脊液净化治疗将脑脊液成分恢复正常的患者；而分期手术的费用相对较高，主要适用于外伤合并颅内出血、动脉瘤破裂术后、颅内肿瘤术后等脑脊液成分异常的患者。