脑脊液生化检查主要是查看患者脑脊液内蛋白的含量、糖的含量以及氯化物的含量。其中，糖和蛋白值是相对重要的指标。大部分颅内感染患者，脑脊液内糖含量会降低，蛋白含量升高，如脑膜炎、脑室炎、脑炎等颅内细菌性感染；但仍有部分特殊感染，如病毒性脑膜炎、脑炎等，会导致早期患者脑脊液内白细胞和蛋白值升高，而糖含量依然在正常水平。