病毒性脑膜炎通常累积大脑软膜，即蛛网膜，因此患者常伴有严重的头痛症状。临床上，患者的脑脊液通常表现为外观清亮透明，生化检查显示内部蛋白含量以及淋巴细胞数等增多，而糖含量维持在正常范围内。对于部分病毒性脑膜炎患者，可以通过检测脑脊液内抗体或扩增脑脊液内DNA或RNA的方法来进一步明确感染源，以进行下一步治疗。