慢性淋病通常都是因为患者早期没有经过足量规范的用药引起的。慢性淋病相对于急性淋病而言，疗程需要延长。如使用头孢曲松钠1g/d，一般需要使用7-10天左右。

在疗程结束停药1周至10天后，有的甚至在停药2周后，即停药时间越长，复查可能越准，要进行实验室检测，进行淋球菌的涂片检测和PCR检测，查看患者是否仍为淋球菌感染。如患者对头孢曲松钠过敏，可选择大观霉素，疗程同使用头孢曲松钠一样，也是至少使用7天。

通常认为淋病发病时间在1个星期之内，像男性比较明显的流脓，就可认为是急性淋病。

患者没有经过规范的治疗或早期未进行治疗，他出现症状时间就比较长，持续时间在1个星期以上，或2个星期迁延不愈，一直都有尿道的脓性分泌物或者少量分泌物，这种情况就认为是慢性淋病。

对于女性，临床上多见的还是慢性淋病，主要因为女性淋病症状非常不典型，女性患者根本不知道自己患有淋病，所以根本无法确定她的病期，只能够通过询问患者大概什么时候发生过高危性行为，来判断这个患者的病程大概有多久。

当然部分患者她并不能完全提供她的病程有多久，通常这种情况下可能就按慢性淋病进行治疗，疗程要相应延长。