子宫腺肌症患者怀孕后可以进行人工流产手术，但与普通患者人工流产手术有少许区别。由于子宫腺肌症患者的子宫比较大，进行人工流产时如果胚胎比较小，会导致残留的概率增加，但临床会通过超声或残留以后再进行手术，或使用宫腔镜的方式解决问题。总体而言，子宫腺肌症患者怀孕后也可以进行人工流产，但并发症概率较高，部分患者可能出现严重的疼痛。

另外正常人进行手术后子宫都会发生收缩，一般是在可忍受的范围内，但部分子宫腺肌症患者疼痛比较严重，一旦发生严重疼痛需要鉴别有无子宫穿孔或其他因素。如果排除以上因素，可能考虑子宫腺肌症患者由于子宫收缩、子宫缺血，或有子宫腺肌症病灶的存在，引起强烈疼痛，患者可以口服或经肛门塞药减少疼痛，通常经过对症处理以后疼痛会有所好转。