药物治疗蛛网膜囊肿无效果，可以通过手术根治。目前主流的手术方式，各位专家趋向于利用神经内镜进行治疗，其手术方式是在内镜的引导下，在内镜的底镜观察下，将蛛网膜与附近的脑池或脑室相通，使蛛网膜内的囊液汇入到脑池或脑室内的脑脊液中，通过正常脑脊液循环进行吸收。患者无需担心，蛛网膜囊肿可以治愈。若发现较小的蛛网膜囊肿，患者可以定期随访，但若是较大的囊肿，且患者产生相应的临床症状，包括头晕、恶心、呕吐或协调功能较差，则可以通过手术的方式根治。