无创DNA检测是产前筛查的范畴，根据我国目前的规定，无创的目标疾病是筛查13-三体、18-三体、21-三体，与传统唐氏筛查的目标疾病相同。但无创与传统唐氏筛查区别在于准确性更高，如21-三体筛查阳性检测率可超过99%。

此外，无创只可筛查以上3对染色体，人有22对染色体，以及1对性染色体，所以还有较多其它疾病不在此筛查范围内。目前胎儿出现染色体异常大部分集中在以上3对染色体，但是无创筛查无异常亦不能代表胎儿完全没有其它问题。