新生儿呼吸窘迫综合征在临床上有很多的并发症。新生儿呼吸窘迫综合征是肺泡表面活性物质缺乏所导致的，一般是早产儿，尤其是小于32周的早产儿、患有糖尿病的母亲还没有发动产程就进行剖宫产的婴儿、出生有窒息的婴儿容易发生该病。患儿患有呼吸窘迫综合征的时候，需采用呼吸机进行辅助治疗。新生儿呼吸窘迫综合征常见的并发症主要为多脏器功能不全，如肝、肾、胰腺、脑部功能的损伤。若病情发展到后期，患儿可能会出现支气管肺发育不良、肺纤维化脱机困难，即使经治疗后顺利脱机，部分患儿仍可能出现肺功能的异常，如潮气量、肺活量及肺容量等较正常人明显减低。