子宫内膜异位的组织腺体或者间质出现在子宫体以外的部位，称为盆腔子宫内膜异位症。绝大部分的盆腔子宫内膜异位症都可累及盆腔腹膜，其中以卵巢、宫骶韧带最为常见。主要的症状是下腹疼痛以及痛经、月经紊乱、不孕以及性交不适；累及到其他部位的，比如肠道、膀胱、输尿管、剖宫产切口以及会阴侧切，会发生相应的一些症状，继发性进行性加重的痛经是盆腔子宫内膜异位的特点。巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢形成的囊液，像巧克力一样而得名。巧克力囊肿存在着破裂的风险，一旦破裂，囊内容物流入盆腔可引起突发性的剧烈腹痛，伴恶心、呕吐以及肛门坠胀，多半发生在行经前后、性交后以及其他腹压增加的情况，症状与宫外孕以及输卵管破裂相似，但没有腹腔内出血。