肾小管性蛋白尿指蛋白尿是由肾小管的重吸收功能不好导致。肾小管性蛋白尿的产生，主要是因为小分子的蛋白可以在肾小球自由滤过，即可以从肾小球排入到原尿中，在原尿中小分子的蛋白，会重新收回人体。

如果患者的肾小管功能不好，这个时候它对小分子的蛋白重吸收率就会减少，患者尿中会出现小分子的蛋白。尿中出现了小分子的蛋白，通常认为患者出现肾小管性蛋白尿。

临床上分类，主要是尿中会出现小分子蛋白，包括α₁-微球蛋白与β₂-微球蛋白。在临床上碰到蛋白尿的患者，通常要给患者进行蛋白尿分型。蛋白尿临床分型比较常见的为肾小球性蛋白尿、肾小管性蛋白尿、溢出性蛋白尿、组织性蛋白尿、混合性蛋白尿等。这时通常会让患者做尿的蛋白分类或尿蛋白电泳。

如果以白蛋白和转铁蛋白为主，通常认为患者出现肾小球性蛋白尿。如果尿中蛋白以α₁-微球蛋白和β₂-微球蛋白为主，这时通常提示患者出现肾小管性蛋白尿。