垂体下丘脑的位置，在大脑的正中间，从两个眼睛中间，鼻根垂直进去大约8-10cm，就是垂体的位置。

垂体和下丘脑是属于下级和上级的关系，下丘脑位于垂体的上面，作为总司令部向垂体发送命令，垂体接收到命令以后再分泌相应的激素，向血液中分泌，给各个靶腺，比如甲状腺肾上腺、性腺再发送命令，让这些器官再产生相应的激素，来调节身体的内分泌代谢。

垂体和下丘脑虽然是在脑袋里面，但是严格来说是在大脑的外面，只是在颅骨以内。这个器官也是非常地重要，如果一旦受到损伤，机体的内分泌系统都会出现紊乱，甚至有的会危及生命。轻症影响男性、女性功能，对于繁衍生育也会受到相应的影响。