肠镜做完肚子咕咕响，通常需要1天左右的时间恢复。进行肠镜检查时，为了能够看清楚，通常需要向肠道内注射气体，使肠腔扩张，帮助发现病变。不同的医院注射的气体不同，多数医院可能会用空气，在检查的过程中，空气在肠道中不容易被吸收，随着肠道蠕动，可能出现串气的表现，可以表现为肠道咕咕响。部分患者可能还会出现腹痛以及胀满感，建议患者排出气体，缓解相应症状。

部分医院进行肠镜检查时，会用二氧化碳气体填充，二氧化碳可以通过肠黏膜吸收，而且吸收速度比较快，做完肠镜以后一般不会有不适的感觉，即使有不适的感觉，很快也能恢复。总而言之做完肠镜以后肚子咕咕响，通常是由于肠道注入气体导致，通常1天左右就能够恢复正常。