通过免疫组化可得到较多信息，比如发现颈部淋巴结转移癌，评估病变来源及具体类型；还可通过免疫组化进行精确诊断。部分癌变会有转移灶，通过影像学检查无法知道其具体类型，此时可通过免疫组化证实。比如比较常见的肺癌，有小细胞癌和非小细胞癌等类型。

病变在分化得好的情况下，可以直接通过HE染色证实。但是如果分化差，鳞癌和腺癌仅在显微镜下无法区分，需要借助免疫组化区分。此外，可以通过免疫组化方法判断PD-L1的表达情况，从而确定是否需要用免疫治疗。