通常因为急性脓胸治疗效果不好，且由于病人的自身有基础疾病，可能会形成慢性脓胸。通常急性脓胸，经过治疗有效的抗生素治疗，对症支持治疗之后，6-8周如果脓腔持续不闭合，可能会形成慢性脓胸。慢性脓胸的治疗和急性脓胸类似，如营养支持治疗，如果病人蛋白低或是贫血，要给予输注白蛋白，纠正贫血，改善病人的身体状况。还要加强引流，有些病人的脓液可能堵塞引流管，此时要调整引流管，促进脓液尽可能的流出。
若经过急性脓胸的抗生素治疗的效果不好，到后期在慢性脓胸的治疗中应用抗生素，效果可能也不会非常理想。如果是慢性脓胸，经过内科的积极的综合治疗，但是脓腔持续的不闭合，则可能要以外科手术为主。但是部分有基础疾病的病人可能也不适合做手术，病人预后可能较差。
