肺孢子菌肺炎是机会性感染疾病，常见于免疫力功能低下的患者，是最常见的严重机会性感染疾病。
感染途径一般为空气传播和体内潜伏性的状态的肺孢子菌的激活。常见于免疫力低下，比如有艾滋病的病人或者是有肿瘤、血液病的病人。治疗除对症治疗与基础疾病的治疗外，还需针对病原治疗。
目前首选复方磺胺甲恶唑，即复方新诺明，若过敏或者是应用效果不好，则选用利奈唑胺、卡泊芬净等比较新的药物。但是这种疾病总体上治疗效果差，预后不佳，疗程也比较长，治疗起来比较困难。
肺孢子菌肺炎治疗主要是建立在诊断的基础上，如果病人有低热、咳嗽、咳痰，而且有基础疾病的病人，在临床上要提前考虑到该疾病可能存在。
