药流肚子比较疼，一般疼痛度是痛经的2-3倍，大部分患者可以耐受，轻于人工流产导致的疼痛。人工流产导致的疼痛大概是痛经的5-6倍，甚至更多。药流第1天给予米非司酮，第3天给予米索前列醇。

药流第1天给予孕激素拮抗剂米非司酮，促使孕囊松动，服用米非司酮一般不会出现腹痛，通常没有任何药物反应，极少数女性服用米非司酮后出现阴道出血，甚至见到孕囊排出。如果服用米非司酮后，已经见到孕囊排出，不需再服用米索前列醇。药流第3天服用宫缩剂米索前列醇而诱发宫缩，引起明显腹痛。一般服用米索前列醇后15-20分钟开始出现宫缩腹痛，宫缩腹痛持续几个小时后可以见到孕囊排出，如果孕囊排出，2周后复查B超以判断是否存在宫腔残留。