多数十二指肠溃疡伴随幽门螺旋杆菌感染，和胃溃疡治疗一样，十二指肠溃疡的治疗，也根据是否合并幽门螺旋杆菌感染判断。合并有幽门螺旋杆菌感染的十二指肠溃疡，给予规范抗幽门螺旋杆菌的标准四联方案，经过一疗程即2周，使用质子泵抑制剂、胃黏膜保护剂和两种抗菌素。多数十二指肠溃疡能够达到根治目的。不伴有幽门螺旋杆菌感染的十二指肠溃疡，主要以质子泵抑制剂和胃黏膜保护剂为主，治疗主要药物包括奥美拉唑、雷贝拉唑等质子泵抑制剂，联合应用胃黏膜保护剂及铋剂，治疗2-4周，多数十二指肠溃疡都能达到根治目的。