肾小球的系膜细胞主要是位于系膜区，肾小球外也有系膜细胞，但是不属于肾小球系膜细胞。系膜区的系膜细胞通常不超过3个，如果发现增多往往认为是系膜增殖导致。肾小球是毛细血管球，系膜细胞主要在系膜区，其作用有支持作用，可以支持肾小球的正常形态。

系膜细胞可以收缩肾脏血管，导致病人出现血压升高等。系膜细胞还可以吞噬大分子蛋白或免疫球蛋白等，吞噬后可以在系膜区观察到免疫球蛋白沉积，比较典型的是IgA肾病，这时系膜细胞可以分泌肾素。如果肾小球系膜细胞出现增殖，此时病人可能会出现血尿、蛋白尿等表现。