白蛋白紫杉醇有自身不良反应，比如神经毒性、骨骼、肌肉疼痛等。在临床应用过程中，白蛋白紫杉醇最常见的不良反应是神经毒性。在神经毒性这方面，与普通紫杉醇相比，虽然出现的时间、程度与普通紫杉醇没有太大差别，但是缓解时间比普通紫杉醇要短。

普通紫杉醇不溶于水，所以必须溶在特殊的溶剂里，比如聚氧乙烯、蓖麻油、无水乙醇等。因此普通紫杉醇易引起过敏反应，白蛋白紫杉醇克服了这个问题，它是把紫杉醇用纳米技术包裹在白蛋白里。因此，白蛋白紫杉醇过敏反应的发生率非常低。