肾盂肾炎通常采取抗感染治疗，根据肾盂肾炎的类型不同，具体用药如下：
1、急性肾盂肾炎患者的用药：急性肾盂肾炎患者若症状不是太严重，此时可考虑口服抗菌素。若患者出现体温超过38.5℃、比较明确的中毒症状、肋脊角压痛比较明显等情况，此时要静脉用药或肌肉注射抗菌素。此时可选择的抗菌素，包括喹诺酮类药物、头孢菌素类的药物等。急性肾盂肾炎的疗程通常是2周，若经过1个疗程治疗后患者的症状仍然没有明确好转，或患者尿里面的细菌还阳性，此时需根据细菌药敏再选择比较强的抗菌素进行治疗，此时抗菌素的疗程一般要求是4-6周，目的就是彻底治疗好急性肾盂肾炎；
2、慢性肾盂肾炎患者的用药：慢性肾盂肾炎的患者同样也是首选抗菌素，但此时所选的抗菌素通常是根据药敏来选择。此外，慢性肾盂肾炎的患者通常要选择效果较强、毒性小一点的抗菌素。还需要注意通常要求慢性肾盂肾炎的患者尽量联用抗菌素，如喹诺酮类的抗菌素、头孢菌素类的抗菌素、呋喃妥因、磺胺类的药物联用。慢性肾盂肾炎的疗程时间也稍微长一点，通常是2-4周。若效果不好，甚至还要考虑给患者进行小剂量、长疗程的抑菌治疗。
