妊娠合并心脏病可以引起孕妇肺动脉高压、缺氧和发绀、心律失常、心脏扩大、心力衰竭、肺水肿、细菌性心内膜炎、静脉栓塞和肺栓塞、心源性休克、猝死等。也会影响胎儿，会发生流产、早产、死胎、胎儿生长受限、胎儿窘迫、新生儿窒息等并发症，治疗心脏病的某些药物也可能对胎儿存在潜在毒性。

大多数先天性心脏病为多基因遗传，如果双亲中任何一方患有先心病，其后代发生先天性心脏病及其它畸形的概率增加五倍，比如室间隔缺损、肥厚型心肌病、马凡综合征等，均有较高遗传性。所以对于合并先心病的孕妇，在胎儿的检查中也要多次做B超，去排查上述心脏结构异常。