通常巧克力囊肿术后注意事项，主要包括以下几点：

1、巧克力囊肿术后，要求术后随访；

2、需要给予患者口服药物治疗，包括非甾体类消炎药、口服避孕药、孕激素类药物，以及左炔诺孕酮宫内节育系统类，以延缓术后复发，减轻患者疼痛等症状；

3、需要给予患者进行针剂治疗，包括不同剂型的GnRH，即促性腺激素释放激素。

巧克力囊肿手术是标准治疗办法之一，术后患者还需进行药物治疗和长期管理，从而延缓复发，减轻症状。此外对于有生育要求患者，建议积极促孕，并寻求生殖科专家帮助。