载脂蛋白主要是由小肠和肝脏合成，与高密度脂蛋白成分一致。载脂蛋白A在身体中有利于清除胆固醇，无太多危害。生理功能包括构成乳糜颗粒，高密度脂蛋白，参与激活卵磷脂胆固醇转移酶以及使得游离胆固醇醇化消除胆固醇作用。临床载脂蛋白分成不同类型，载脂蛋白A主要参与胆固醇代谢过程，有利于胆固醇降低，对于动脉粥样硬化存在保护性作用。
载脂蛋白B多与低密度脂蛋白相关，这种情况主要作用是导致动脉粥样硬化，对于身体产生不利影响。