胆总管囊肿是小儿外科的常见疾病，也是小儿胆道的常见疾病之一，建议尽早手术。胆总管囊肿是一种病理状态，可以导致各种严重的并发症。比如可以继发胆道结石、胆道炎症。严重的甚至可以导致胆管穿孔、反复的胰腺炎。

另外，一些患儿可以出现肝功能损害，甚至肝纤维化。在胆总管囊肿的个别患儿中间，后期胆道出现癌症的可能性会高于正常患儿。为减少这些并发症的发生，胆总管囊肿一旦确诊，建议尽早手术。