颈椎针灸后头痛厉害需要具体问题具体分析，临床上出现的是比较少的，有可能是以下几种原因：

1、体位不当：在针刺颈椎的时候，一般采用俯卧位，俯卧位的过程中，如果摆放的体位没有摆放特别得当，有可能继发头部的不适，出现头疼的表现；

2、局部受凉：在针刺颈椎的时候，如果时间比较长，出现局部受风、受凉，或者诊室的环境没有控制好，经常有人开门，导致人体受风受凉，进而可能导致头部受凉受风，出现头疼的表现；

3、后遗得气感：在针刺颈椎的时候，也会选择一些颅底的穴位或者后枕部的一些穴位，如玉枕、脑户、脑空、风池、风府、哑门、完骨等这样的一些穴位。在针刺的过程中，如果有一些后遗针感，就是针灸的时候出现的酸、麻、胀、重、痛，这些都叫做得气感，或者叫做针感。有些人这种针感是比较明显的，比如选择一些颅底的穴位，或者一些后枕部的穴位进行针灸，针刺完同时还会遗留一些后遗的针感，后遗的针刺得气感的表现，也有可能是产生头疼的原因。但是这种得气感不用担心，一般程度比较轻，持续时间比较短，一般24小时之内，多数也就消失了。

所以具体是什么样的原因，导致针刺颈椎以后的这种头部的疼痛，还要具体问题具体分析。