十几年前脑干区域是手术禁区，所以脑干区域的出血一般会采取保守治疗。当患者出现脑积水和后颅窝的颅高压危象时，可考虑行后颅窝减压术，直接手术较少采用。

近年来随着显微神经外科技术的发展，医生对脑干解剖和脑干手术入路认识的加深，部分医生和单位有可能采取直接手术，包括脑干血肿置管、引流和直接开颅清除血肿，有取得满意的疗效的报道。脑干出血致残率、致死率极高，是否手术要根据当地医疗水平和家属的期望、医生的经验综合判断。