吗替麦考酚酯胶囊的作用为免疫抑制、抗器官移植后排斥免疫。吗替麦考酚酯是免疫抑制剂的一种，此药物和他克莫司、激素组合成为器官移植后免疫抑制方案的基石，这三类药物是临床最常用术后抗排斥免疫方案。

吗替麦考酚酯临床应用最常见的不良反应是腹泻，多于患者术后服用药物1-2天内发生，敏感患者会出现非常严重的腹泻，出现水样便。医生和药师可能会采用蒙脱石散或者洛哌丁胺进行对症处理，如果吗替麦考酚酯引起的腹泻比较严重、难以控制，可能会换其他药物进行治疗。使用这类药物，应关注安全性问题。