多囊卵巢与卵巢囊肿有较大区别，具体如下：

1、多囊卵巢：是多囊卵巢综合的B超表现，通常表现为B超下观察到卵巢有多个小卵泡出现，直径在1cm左右，但没有优势卵泡形成，也没有排卵、规律性雌孕激素变化、规律性来月经，临床常表现为月经紊乱，伴有不孕，检查内分泌会发现雄激素升高或LH黄体生成素相对升高；

2、卵巢囊肿：是单独的一类疾病，是卵巢肿瘤性疾病，通常表现为卵巢单发囊性肿物，卵巢囊肿又包括多种情况，比较常见的是生理性卵巢囊肿，直径＜3-4cm，囊壁较薄，是指黄体囊肿或者滤泡囊肿，不需要任何治疗，过1-2次月经之后会自行消退。卵巢囊肿还包括赘生性肿物，如卵巢巧囊、卵巢浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤、畸胎瘤等需要手术治疗。