对于乳腺导管内乳头状瘤，现在绝大多数的只有通过手术可直接将导管内乳头状瘤切除。导管的乳头状瘤通常体积很小，多数时候可能为1-2mm，有时甚至切下来以后用肉眼都无法看清。但现在检查的手段很多，可以通过乳管镜发现，并且可以通过乳管镜放置导丝、标志，然后找到标志，进行完整的切除。

导管内乳头状瘤实际上多数时候属于多发，因此切除的范围可能需要稍微扩大，并且取出的办法仍为手术切除。此外也可以通过乳管镜应用激光把肿物烧除或者通过乳管镜用活检钳将乳头状瘤钳出，但均为非常少用的方法，因为很多医院并没有配备的器材，比如应用激光灼烧的器材无法取得病理组织，所以存在一定的局限，因此大部分医院仍通过手术的方法将其去除。