梅杰综合征并非不治之症，可以通过药物及手术进行治疗。轻症患者可以口服药物治疗，如安坦、巴氯芬、氟哌啶醇、氯硝西泮等药物。

药物控制效果不佳时可采用肉毒毒素注射治疗，肉毒毒素可麻痹神经肌肉接头，注射后患者可出现轻度面瘫，但患者的眼睑痉挛和口、下颌肌张力障碍可以得到有效控制。

部分患者注射肉毒毒素后可能发生过敏或疗效不佳等情况，此时可以采用外科手术治疗，如脑深部电刺激。经验较丰富的神经外科医生通过准确靶点植入治疗梅杰综合征，患者术后症状可明显改善，且疗效较为持久。