多数患者出现病毒性肠炎，通常可在3-7天恢复甚至自愈。若患者既往体健，出现病毒性肠炎时应注意饮食的调整、休息，症状通常可在2-3天明显好转。而对于体质较弱的患者，则需要进行营养支持，如腹泻较严重的情况下可以给予口服补液盐，甚至蒙脱石散等止泻药以减少大便次数，有助于疾病的好转。

若患者既往存在病史，如溃疡性结肠炎合并病毒感染，则可能进一步加重症状，不仅大便次数增多，还可能出现粘液脓血便甚至高热。此时患者需积极进行抗病毒治疗，甚至给予更昔洛韦三周的治疗，症状才能明显好转。所以若既往体健的患者出现病毒性肠炎预后较快，但对于既往存在基础疾病且体质较差的患者，预后相对较慢。对于特殊人群，如溃疡性结肠炎合并病毒感染的患者，更应积极、规律进行治疗，以避免引起严重并发症。