新型冠状病毒肺炎治愈后，有可能留下后遗症。目前国外报道最多的新型冠状病毒肺炎，治愈后的后遗症是乏力、精神差。国外的报道大部分病人治愈后，都会出现轻重程度不等的乏力，甚至可以影响正常的工作和生活。还可以遗留味觉、嗅觉缺失或减弱的后遗症，是否有肺部后遗症，如肺部纤维化，还有待进一步的临床研究。
目前的临床表现和数据收集情况表明，新型冠状病毒肺炎的病人可以出现多脏器损伤，如肝脏、肾脏损伤，但肝肾功能的损伤是否会永久存在，目前还没有定论。大多数病人的肝肾损伤是可逆情况，因此新型冠状病毒肺炎的后遗症问题，还需要进一步的临床研究才能明确。
